Alguien compró en tu tienda el 28 de septiembre, no pidió factura y hoy te manda su RFC por correo. Tienes que facturarle: el SAT considera práctica indebida negarla porque no se pidió al comprar, y permite emitirla después mientras sea en el mismo año. Si esa venta ya iba en tu factura global de septiembre, son tres movimientos: cancelar la global, emitirla de nuevo sin esa venta y timbrar la factura del cliente.
Atémpora es una agencia de Shopify, así que los pasos concretos son de Shopify; las reglas del SAT aplican igual en WooCommerce, Tiendanube o cualquier otra plataforma. Nada de esto sustituye la asesoría fiscal: valida con tu contador tu régimen, la periodicidad de tu factura global y cada cancelación antes de configurar algo.
Qué documento fiscal emites en cada caso
Casi todas las dudas de facturación en una tienda en línea caben en siete situaciones.
Situación | Qué emites | Fundamento | Plazo |
|---|---|---|---|
El cliente pide factura en el checkout | CFDI de ingreso a su nombre, con RFC, nombre, código postal fiscal, régimen y uso del CFDI | CFF art. 29 y 29-A fr. IV; Anexo 20 (CFDI 4.0) | Al momento de la venta, si te la pide |
La pide días después y tu factura global de ese periodo aún no sale | CFDI a su nombre; esa venta ya no entra en la global | SAT, prácticas indebidas en la emisión de facturas (punto 6) | Dentro del mismo año de la compra |
La pide después de que emitiste la factura global | Cancelas la global con motivo 04, la emites de nuevo sin esa venta y timbras el CFDI a su nombre | CFF art. 29-A; SAT, Esquema de cancelación de CFDI 2026 | Dentro del mismo año; la cancelación, a más tardar en el mes en que presentas la declaración anual de ese ejercicio |
No la pide | La venta va en tu factura global con RFC XAXX010101000 | RMF 2026, reglas 2.7.1.21 y 2.7.1.23 | 24 horas después del cierre del periodo (diario, semanal o mensual) |
Vendes en Mercado Libre o Amazon y te retienen | Tú facturas al comprador (o lo incluyes en tu global); la plataforma te entrega un CFDI de retenciones | LISR art. 113-A y 113-C fr. II; LIVA art. 18-J; LIF 2026 art. 25 fr. VI y IX | El CFDI de retenciones, dentro de los 5 días siguientes al mes |
Devolución de una venta ya facturada | CFDI de egreso (nota de crédito) relacionado con la factura original o con la global | LIVA art. 7; Guía de llenado del CFDI global (ejemplo de devolución) | Cuando reembolsas |
El pedido se canceló antes de enviarse y cobrarse | Cancelas el CFDI con motivo 03, "No se llevó a cabo la operación" | CFF art. 29-A; SAT, Esquema de cancelación de CFDI 2026 | A más tardar en el mes en que presentas la declaración anual de ese ejercicio |
Ojo con la fila del marketplace: la retención no sustituye la factura. La ayuda de Mercado Libre le indica al comprador que se la pida al vendedor desde el detalle de la compra.
Los datos que necesitas del cliente
Desde el 1 de abril de 2023 el CFDI 4.0 es la única versión válida y pide cinco datos del receptor: RFC, nombre o razón social, código postal fiscal, régimen fiscal y uso del CFDI. Los cuatro primeros salen de la Constancia de Situación Fiscal; el nombre va en mayúsculas, tal como aparece ahí, y si el uso no corresponde al régimen del cliente, el timbrado falla.
El SAT también enlista lo que no puedes hacer: condicionar la factura a que te manden la Constancia, subir el precio cuando la piden u obligar al cliente a usar un portal. La tercera le pega a las tiendas en línea: si alguien te pide la factura por correo o WhatsApp, la emites tú.
¿Y Shopify? Cuando el pedido va a México y tu tienda factura desde México, el checkout muestra tres campos opcionales: RFC, Régimen Fiscal y Uso de CFDI. Si el cliente los llena, según su ayuda, la tienda tiene que emitirle la factura. Faltan el nombre y el código postal fiscal, que no siempre coinciden con la dirección de envío, así que la app de facturación los pide después, en la página de agradecimiento o en la cuenta del cliente.
Factura global: periodicidad, plazo y RFC genérico
La factura global ampara las ventas en las que nadie pidió factura. La regla 2.7.1.21 de la Resolución Miscelánea Fiscal para 2026 permite emitirla de forma diaria, semanal o mensual, con el importe y el folio de cada operación y el IVA separado, y da 24 horas después del cierre del periodo para timbrarla. Según la guía de llenado del SAT, el receptor va así: RFC XAXX010101000, nombre "PUBLICO EN GENERAL", régimen 616, uso S01 y, como código postal, el de tu lugar de expedición. Para clientes del extranjero sin RFC mexicano, la clave genérica es XEXX010101000.
Si tributas en el RESICO, la Ley del ISR (art. 113-G, fracción V) te obliga a emitir la global y dice que solo puedes cancelarla en el mes en que la emitiste. El esquema de cancelación 2026 del SAT menciona una facilidad de la Miscelánea para cancelarla hasta el último día de abril del año siguiente. Con dos reglas que no dicen lo mismo, tu contador decide antes de que canceles.
Ahora, la decisión práctica. Con global mensual, que emites el día 1 del mes siguiente, el cliente que pide factura durante el mes recibe su CFDI y esa venta no entra en la global: no cancelas nada. Con global diaria, la venta del lunes ya quedó en la global del martes, y casi cualquier factura tardía te obliga a cancelar y reemitir, que son dos timbres y una cancelación en lugar de un timbre. Lleva esta consecuencia a la plática con tu contador.
Precios con IVA incluido
El artículo 7 Bis de la Ley Federal de Protección al Consumidor obliga a mostrar de forma notoria el monto total a pagar, y el SAT dice que el precio debe incluir el IVA pida o no factura el cliente. El precio de la ficha es el que se paga, sin "más IVA" en el checkout.
Si tu tienda muestra los precios sin impuestos y los suma en el pago, lo cambias en Configuración > Impuestos y aranceles, con la opción de incluir el impuesto en el precio del producto y en la tarifa de envío. Shopify calcula el impuesto como tasa × precio / (1 + tasa), así que un producto de $1,160 lleva $160 de IVA y $1,000 de base. Si la activas sin subir precios, lo que vendías en $1,000 más IVA te deja $862.07 de base, 13.8 % menos por venta. Recalcula tu lista antes con la calculadora de precio de venta.
Retenciones cuando vendes en un marketplace
Cuando una plataforma intermedia y cobra por tu cuenta (Mercado Libre, Amazon, TikTok Shop), te retiene impuestos de cada venta. En 2026, la Ley de Ingresos de la Federación (art. 25, fr. VI) subió la retención de ISR por venta de bienes de 1 % a 2.5 % y la extendió a personas morales; si no le das tu RFC a la plataforma, sube a 20 %. En IVA retiene la mitad (8 de los 16 puntos) a personas físicas, según el artículo 18-J de la Ley del IVA, y la fracción IX del mismo artículo 25 de la LIF lo aplica a personas morales.
En tu tienda propia no pasa lo mismo. La retención aplica a los servicios de intermediación entre terceros (art. 18-B, fr. II, de la Ley del IVA), y en tu tienda tú eres el vendedor y la pasarela solo procesa el cobro. El blog de Mercado Pago lo dice sin rodeos: los cobros directos, como transferencias o links de pago, no están sujetos a este esquema. Cobrar con Shopify Payments, Mercado Pago o Stripe en tu propio sitio no te genera estas retenciones; esos ingresos los declaras tú.
En el marketplace, la plataforma te entrega un CFDI de retenciones dentro de los cinco días siguientes al mes (LISR art. 113-C, fr. II), y tu contador lo usa para acreditar lo retenido. Cuánto te queda por venta en cada canal, con comisión, envío y retenciones, está en nuestra comparativa de margen por marketplace.
Cómo automatizar la facturación en Shopify
Shopify no timbra CFDI: captura RFC, régimen y uso en el checkout, y el timbrado lo hace una app conectada a un proveedor de certificación. Si operas con un ERP o varios canales, la arquitectura cambia, y la explicamos en automatización de ecommerce en México. Para una tienda que vende solo en Shopify, una app resuelve casi todo.
Lo que necesitas antes de instalar la app
Necesitas tres cosas: tu Certificado de Sello Digital (CSD) del SAT, que es distinto de la e.firma; la clave de producto o servicio del SAT de cada artículo, que las apps te dejan asignar desde Shopify; y los precios con IVA incluido, porque la app toma el desglose de impuestos del pedido. Con eso, activas la autofactura en la página de agradecimiento y la cuenta del cliente, y programas la global con la periodicidad que definió tu contador. El resto de la configuración de la tienda está en la guía de Shopify para México.
Cuánto cuesta al mes
Las apps cobran con mensualidad ilimitada, con mensualidad baja más un cobro por factura o con paquetes. Comparamos el caso más caro, en el que cada pedido termina en un CFDI, y el más barato, en el que solo timbras una global al mes. Son precios de la Shopify App Store consultados el 10 de octubre de 2026, convertidos a $18.40 por dólar (FIX de Banxico del 9 de octubre de 2026).
App y calificación | Cómo cobra | Fórmula (n = facturas al mes) | 100 pedidos | 500 pedidos | Nadie pide factura (1 global) |
|---|---|---|---|---|---|
Facturama (3.8, 32 reseñas) | USD 13, autofactura y global ilimitadas | 13 | USD 13 = $239.20 | USD 13 = $239.20 | USD 13 = $239.20 |
CFDI Express Basic (4.9, 25 reseñas) | USD 15 + USD 0.10 por factura generada o cancelada | 15 + 0.10 × n | USD 25 = $460.00 | USD 65 = $1,196.00 | USD 15.10 = $277.84 |
Palma Pro (5.0, 5 reseñas) | USD 9 + USD 0.20 por factura timbrada | 9 + 0.20 × n | USD 29 = $533.60 | USD 109 = $2,005.60 | USD 9.20 = $169.28 |
FiscalPOP (1.7, 6 reseñas) | USD 4 + USD 0.10 por factura | 4 + 0.10 × n | USD 14 = $257.60 | USD 54 = $993.60 | USD 4.10 = $75.44 |
Sellu (sin reseñas) | Paquetes con timbres incluidos: 15 gratis, 150 por USD 12, 500 por USD 29 | Plan con n incluidas | USD 12 = $220.80 | USD 29 = $533.60 | USD 0 = $0 |
A 500 facturas al mes, la tarifa fija de Facturama sale entre 4 y 8 veces más barata que las apps que cobran por factura. Si casi nadie te pide factura, el orden se invierte: Sellu gratis, FiscalPOP y Palma cuestan menos de $200 al mes. Según las fórmulas, Facturama le gana a Palma Pro desde 21 facturas al mes y a FiscalPOP desde 91, y CFDI Express nunca baja de USD 15, más que Facturama. Además, CFDI Express y Palma Pro cobran USD 0.10 por cancelación, así que una factura tardía después de la global son tres cobros.
La calificación pesa tanto como el precio: FiscalPOP tiene 1.7 con seis reseñas, una reciente con quejas del soporte, y Sellu no tiene reseñas. CFDI Express (25 reseñas) y Facturama (32, con 6 de una estrella) son las de más historial.
Nuestra recomendación
Activa los precios con IVA incluido el primer día, antes que cualquier app: es lo que ve el cliente y lo que exige la ley del consumidor. Después, pídele a tu contador que defina la periodicidad de la global pensando en cómo te piden factura tus clientes. En una tienda en línea, la mensual es la que menos cancelaciones genera.
Para elegir app, haz la cuenta con tu volumen real de facturas, que casi nunca es igual al de pedidos. Por precio, Facturama es la más barata desde unas 150 facturas al mes; por debajo, Sellu, FiscalPOP o Palma pueden costar menos. CFDI Express es la mejor calificada entre las de más de 20 reseñas y cuesta más en cualquier volumen, y nosotros pagaríamos esa diferencia antes que depender de una app con 1.7 para algo que el SAT revisa. Y no dejes el portal de autofactura como única vía, porque quien te pida la factura por correo tiene derecho a recibirla.
Preguntas frecuentes
¿Puedo negarme a facturar si el cliente no pidió la factura al comprar?
No. El SAT lo considera práctica indebida y permite emitir la factura después, mientras sea en el mismo año de la compra. Si la venta ya estaba en tu factura global, cancelas la global con motivo 04, la emites de nuevo sin esa venta y timbras la factura del cliente.
¿Cada cuánto tengo que emitir la factura global?
La regla 2.7.1.21 de la Miscelánea Fiscal para 2026 permite periodicidad diaria, semanal o mensual, con 24 horas después del cierre del periodo para timbrarla. Tu contador define cuál te conviene.
¿Mercado Pago me retiene ISR e IVA en las ventas de mi tienda Shopify?
No. La retención aplica cuando la plataforma intermedia entre vendedor y comprador, como Mercado Libre. Mercado Pago explica que los cobros directos, como transferencias o links de pago, no están sujetos a ese esquema.
¿Shopify emite facturas CFDI?
No. El checkout de Shopify puede pedir RFC, régimen fiscal y uso del CFDI, pero el timbrado lo hace una app de facturación con tu Certificado de Sello Digital.
¿Puedo cobrar más si el cliente pide factura?
No. El SAT enlista como práctica indebida subir el precio cuando el cliente pide factura: el precio debe incluir el IVA desde el inicio.
¿Quieres abrir tu tienda con el IVA bien configurado desde el primer día?
Con Lanzamiento tu tienda Shopify queda lista en 2 semanas por $16,000 MXN con IVA, hasta 6 meses sin intereses, con hasta 50 productos y el IVA de tus precios configurado (no incluye migración). Si ya vendes y quieres que alguien opere la tienda cada mes, la gestión mensual empieza en $14,000 MXN al mes.
